dimanche 16 février 2014

Un ancêtre masculin de l'Homme Moderne est né entre 340.000 et 208.000 ans

Un ancêtre masculin de l'Homme Moderne est né entre 340.000 et 208.000 ans d'après deux études contradictoires.
Hominid
Il s'appelait Albert Perry. Décédé il y a quelques années, c'était un Afro-Américain vivant en Caroline du Sud, lointain descendant d'esclaves que la traite négrière avait amenés d'Afrique de l'ouest dans le Nouveau Monde. On n'en saura guère plus sur lui, si ce n'est, comme le rapporte le New Scientist, qu'un jour, une de ses parentes envoya un échantillon contenant son ADN à une entreprise proposant d'en extraire des informations sur ses origines. Ces tests de généalogie génétique sont réalisés à partir d'ADN mitochondrial, qui est transmis par la mère à ses enfants et retrace la lignée maternelle (la mère, la grand-mère maternelle, la mère de celle-ci, etc.), ou bien – et seulement pour les mâles – à partir du chromosome Y. Celui-ci donnera des informations sur la lignée paternelle (le père, le grand-père paternel, son père, etc.).
Lorsque l'échantillon d'Albert Perry atterrit dans le laboratoire chargé d'effectuer cette analyse, un problème inédit apparut : la séquence génétique portée par son chromosome Y ne ressemblait à rien de connu. Pour le dire autrement, on peut faire remonter tous les chromosomes Y des hommes de la Terre au plus récent ancêtre masculin commun, un homme qui vivait en Afrique il y a environ 140 000 ans. Ce dernier est surnommé l'« Adam génétique » en référence au premier homme de l'Ancien Testament (il y a aussi une Eve mitochondriale). Mais le chromosome Y d'Albert Perry ne descendait pas de cet Adam-là.
Cette surprenante exception a poussé une équipe internationale à approfondir les recherches sur ce chromosome Y si particulier et les résultats de ce travail viennent d'être publiés dans l'American Journal of Human Genetics (AJHG). Puisque, de toute évidence, l'Adam génétique d'il y a 140 000 ans n'était plus le bon, tout l'arbre phylogénétique du chromosome Y humain, qui retrace sa généalogie dans le monde entier, était à reconstruire. En comparant entre elles les variations génétiques de différents groupes ethniques, en les comparant aussi avec celles de notre proche cousin le chimpanzé et en estimant la vitesse à laquelle ces mutations apparaissent, ces chercheurs ont pu remonter dans le temps et greffer l'arbre généalogique précédemment en vigueur sur un tronc plus ancien d'où partait la branche qui a porté le chromosome Y d'Albert Perry.
Et l'arbre a pris un bon coup de vieux. Selon leurs calculs, le nouvel Adam génétique, l'ancêtre dont sont issus le chromosome Y de tous les hommes actuels et le chromosome Y d'Albert Perry, vivait toujours en Afrique, mais il y a près de 340 000 ans. Comme l'a déclaré au New Scientist Jon Wilkins, du Ronin Institute dans le New Jersey, qui n'a pas pris part à cette étude, depuis que l'on fait de la génétique on a « regardé les chromosomes Y. Déplacer à ce point la racine de l'arbre du chromosome Y est extrêmement surprenant. »
Mais en plus de constituer une surprise, ce bouleversement pose un gros problème de date, tout simplement parce que, il y a 340 000 ans, l'homme moderne n'était pas encore né ! D'après les données fossiles, son apparition date d'il y a environ 200 000 ans. Comment Albert Perry, qui était sans nul doute un Homo sapiens, a-t-il pu se retrouver porteur d'un chromosome Y datant d'un Homo "archaïque" alors que tous ses congénères disposaient d'une version plus récente ? Casse-tête ? Pas vraiment si l'on considère que le scénario de l'évolution de l'homme est non pas linéaire mais semblable à un buisson dont les branches se séparent... puis se recroisent. Une hypothèse probable est que, il y a plusieurs milliers d'années, le groupe ethnique d'Homo sapiens dont Albert Perry est descendu s'est mélangé avec un groupe d'humains "archaïques". Ces derniers ont aujourd'hui disparu mais ils ont, lors de cet échange de gamètes, réinjecté dans la population d'hommes modernes un chromosome Y qui n'y était plus présent sous cette forme. Un chromosome qui s'est ensuite transmis de père en fils pendant des générations et des générations, jusqu'à Albert Perry... et à quelques autres.
Les noeuds de notre arbre généalogique
Le premier fossile de la version moderne de l’être humain remonte à environ 200 000 ans. Ce qui signifie que la lignée du chromosome Y d’Albert Perry s’est détachée du reste de l’humanité bien avant que notre espèce n’apparaissent.
Mais étant donné qu’Albert combinait toutes les caractéristiques de l’homme moderne – mais avec un chromosome Y plus ancien !- , l’hypothèse la plus probable est, qu’à un moment donné, un groupe d’Homo Sapiens s’est mélangé à un groupe d’humains "archaïques" aujourd’hui disparus.
En effet, à l’apparition de l’Homo Sapiens tel que nous le connaissons aujourd’hui, d’autres groupes d’humains existaient déjà : l’homme de Néandertal en faisait partie, tout comme l’Homo Rhodesiensisou les DenisovansIls ont survécu, pour certains, jusqu’à une période comprise entre – 30 000 et – 10 000 ans et aurait donc très bien pu se mélanger à d’autres populations.
Ces groupes auraient ainsi réinjecté dans la population moderne leur chromosome Y primitif,qui s’est ensuite transmis de père en fils jusqu’à Albert Perry.
En explorant des bases de données génétiques, les auteurs de l'étude ont fini par mettre la main sur les Mbo, un peuple africain vivant dans le sud-ouest du Cameroun, dans la région du Littoral. Dans cette base de données se trouvaient 11 hommes Mbo (sur 174 enregistrés) dont le chromosome Y présentait des caractéristiques analogues à celles du chromosome Y d'Albert Perry – lequel était probablement leur lointain cousin. Les chercheurs notent que les Mbo vivent à moins de 800 kilomètres du site préhistorique nigérian d'Iwo Eleru, où des paléoanthropologues ont établi qu'Homo sapiens a cohabité et s'est reproduit avec les descendants d'une lignée plus ancienne Là-bas, des ossements présentant un étrange mélange de caractéristiques modernes et anciennes ont été retrouvés. Pour ces généticiens, une découverte comme celle du chromosome Y d'Albert Perry souligne à quel point les bases de données sont lacunaires : « Il est probable, écrivent-ils, qu'une bien meilleure compréhension de la phylogénie du chromosome Y, et des variations génétiques en général, serait obtenue si des relevés plus denses et plus réguliers étaient effectués dans toute l'Afrique subsaharienne, étant donné son haut niveau de diversité génétique. »
Pour en savoir plus, voici l’étude de l'équipe de M. Mendez publiée dans l’American Journal of Human Genetics, d’où est tirée cette histoire.
Une réponse contradictoire est apparue depuis, qui recentre l'ADN en question à 208.000 ans environ, plus conforme aux découvertes archéologiques, même si cela repousse encore un peu plus la réelle apparition de l'Homme Moderne... :
Mendez and colleagues reported the identification of a Y chromosome haplotype (the A00 lineage) that lies at the basal position of the Y chromosome phylogenetic tree. Incorporating this haplotype, the authors estimated the time to the most recent common ancestor (TMRCA) for the Y tree to be 338000 years ago (95% CI=237000–581000). Such an extraordinarily early estimate contradicts all previous estimates in the literature and is over a 100000 years older than the earliest fossils of anatomically modern humans. This estimate raises two astonishing possibilities, either the novel Y chromosome was inherited after ancestral humans interbred with another species, or anatomically modern Homo sapiens emerged earlier than previously estimated and quickly became subdivided into genetically differentiated subpopulations. We demonstrate that the TMRCA estimate was reached through inadequate statistical and analytical methods, each of which contributed to its inflation. We show that the authors ignored previously inferred Y-specific rates of substitution, incorrectly derived the Y-specific substitution rate from autosomal mutation rates, and compared unequal lengths of the novel Y chromosome with the previously recognized basal lineage. Our analysis indicates that the A00 lineage was derived from all the other lineages 208 300 (95% CI=163 900–260 200) years ago."
" (...) Nous démontrons que l'estimation TMRCA (de la publication ci-dessus de Mendez) a été atteint par des méthodes statistiques et analytiques inadéquates, chacunes ayant contribué à son inflation. Nous montrons que les auteurs ont ignoré les précédents supposés taux spécifiques de substitution de Y, à tort dérivés le taux spécifique de substitution Y du taux de mutation autosomique, et ont comparé des rapports de longueurs inégaux d'un nouveau chromosome Y avec la lignée basale déjà reconnue. Notre analyse indique que la lignée A00 a été dérivée à partir de toutes les autres lignées il y a quelques 208 300 années (IC à 95% = 163 900 à 260 200). "
Voilà la liste, avec les dates, des plus anciens fossiles d'hominidés et d'hommes modernes découverts officiellement, avec quelques photos :
Yves Herbo Traductions-Sciences-F.Histoires-15-02-2014

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