Génétique: une nouvelle migration ancienne en Europe inconnue
L'analyse du génome révèle une ancienne migration humaine inconnue en Europe
Le séquençage génétique de restes humains datant de 45 000 ans a révélé une migration jusque-là inconnue en Europe et a montré que le mélange avec les Néandertaliens au cours de cette période était plus courant qu'on ne le pensait auparavant.
La recherche est basée sur l'analyse de plusieurs restes humains anciens - y compris une dent entière et des fragments d'os - trouvés dans une grotte en Bulgarie l'année dernière.
Le séquençage génétique a révélé que les restes provenaient d'individus qui étaient plus étroitement liés aux populations actuelles d'Asie de l'Est et des Amériques qu'aux populations d'Europe.
" Cela indique qu'ils appartenaient à une migration humaine moderne en Europe qui n'était pas connue auparavant par les archives génétiques ", indique la recherche, publiée mercredi dans la revue Nature .
Il " fournit également la preuve qu'il y avait au moins une certaine continuité entre les premiers humains modernes en Europe et plus tard les gens en Eurasie ", a ajouté l'étude.
Les résultats " ont changé notre compréhension antérieure des premières migrations humaines en Europe ", a déclaré Mateja Hajdinjak, chercheur associé à l'Institut allemand Max Planck d'anthropologie évolutive qui a aidé à diriger la recherche.
" Cela a montré comment même la toute première histoire des Européens modernes en Europe a pu être tumultueuse et impliquer des remplacements de population ", a-t-elle déclaré à l'AFP.
Le secteur Niche 1 (à gauche) et le secteur Main (à droite) lors des fouilles de la grotte Bacho Kiro, Bulgarie, en 2016. La zone de ciment au premier plan a été excavée auparavant dans les années 1970. De nouvelles fouilles ont repris là où ces fouilles s'étaient arrêtées. Crédits: MPI-EVA / Nikolay Zaheriev
Une possibilité soulevée par les résultats est " une dispersion de groupes humains qui seront ensuite remplacés (par d'autres groupes) plus tard en Eurasie occidentale, mais continueront à vivre et à contribuer à l'ascendance des gens en Eurasie orientale ", a-t-elle ajouté. YH: autrement dit, les premiers arrivés en Europe de l'Ouest n'y sont pas restés en majorité mais ont voyagé vers l'Asie, et leurs descendants sont ensuite revenus en partie d'Asie, et ces derniers ont remplacé leurs ancêtres locaux.
Les restes ont été découverts l'année dernière dans la grotte Bacho Kiro en Bulgarie et ont été salués à l'époque comme preuve que les humains vivaient aux côtés des Néandertaliens en Europe beaucoup plus tôt qu'on ne le pensait.
L'analyse génétique a également révélé que les humains modernes en Europe à cette époque se mélangeaient davantage avec les Néandertaliens qu'on ne le supposait auparavant.
Tous les « individus des cavernes de Bacho Kiro ont des ancêtres néandertaliens cinq à sept générations avant de vivre, ce qui suggère que le mélange (hybridation) entre ces premiers humains en Europe et les néandertaliens était commun », a déclaré Hajdinjak.
Lire la suite ci-dessous :
Les preuves antérieures d'un mélange précoce entre l'homme et le néandertal en Europe provenaient d'un seul individu appelé Oase 1, datant de 40 000 ans et trouvé en Roumanie.
Les restes trouvés dans la grotte Bacho Kiro en Bulgarie remontent à 45 000 ans dans certains cas
" Jusqu'à présent, nous ne pouvions pas exclure que ce soit une découverte fortuite ", a déclaré Hajdinjak.
" Notre étude suggère que cela devait être courant ."
Les résultats ont été accompagnés d'une recherche distincte publiée mercredi dans la revue Nature Ecology and Evolution impliquant le séquençage du génome d'échantillons d'un crâne trouvé en République tchèque.
Le crâne a été trouvé dans la région de Zlaty kun en 1950, mais son âge a fait l'objet de débats et de découvertes contradictoires au cours des décennies qui ont suivi.
L'analyse initiale avait suggéré qu'il avait plus de 30 000 ans, mais la datation au radiocarbone avait donné un âge plus proche de 15 000 ans.
" L'analyse génétique semble maintenant avoir résolu le problème, suggérant un âge d'au moins 45 000 ans ", a déclaré Kay Prufer du département d'archéogénétique de l'Institut Max Planck, qui a dirigé la recherche.
" Nous profitons du fait que tous ceux qui retracent leur ascendance aux individus qui ont quitté l'Afrique il y a plus de 50 000 ans portent un peu d'ascendance néandertalienne dans leurs génomes ", a-t-il déclaré à l'AFP.
Ces traces de Néandertal apparaissent en blocs courts dans les génomes humains modernes, et de plus en plus longs plus loin dans l'histoire humaine.
" Chez les individus plus âgés, comme l'homme Ust'-Ishim de 45 000 ans de Sibérie, ces blocs sont beaucoup plus longs ", a déclaré Prufer.
" Nous constatons que le génome de la femme Zlaty kun a des blocs encore plus longs que ceux de l'homme Ust'-Ishim. Cela nous rend confiants qu'elle a vécu en même temps, voire plus tôt."
Bien qu'il date à peu près de la même période que les restes de Bacho Kiro, le crâne de Zlaty kun ne partage pas de liens génétiques avec les populations asiatiques ou européennes modernes.
Prufer espère maintenant étudier comment les populations qui ont produit les deux ensembles de restes étaient liées.
" Nous ne savons pas qui étaient les premiers Européens qui se sont aventurés dans une terre inconnue ", a-t-il déclaré.
" En analysant leurs génomes, nous découvrons une partie de notre propre histoire qui a été perdue dans le temps."
Résumé 1 : " Nous présentons ici des données à l'échelle du génome de trois individus datés entre 45930 et 42580 ans de la grotte Bacho Kiro, Bulgarie. Ce sont les premiers humains modernes du Pléistocène tardif connus pour avoir été récupérés en Europe jusqu'à présent, et ont été trouvés en association avec un assemblage d'artefacts du Paléolithique supérieur initial. Contrairement à deux individus précédemment étudiés d'âges similaires de Roumanie et de Sibérie qui n'ont pas contribué de manière détectable aux populations ultérieures, ces individus sont plus étroitement liés aux populations actuelles et anciennes d'Asie de l'Est et des Amériques qu'aux populations plus tardives d'Eurasie occidentale. Cela indique qu'ils appartenaient à une migration humaine moderne en Europe qui n'était pas connue auparavant par les archives génétiques, et fournit la preuve qu'il y avait au moins une certaine continuité entre les premiers humains modernes en Europe et les peuples ultérieurs en Eurasie. De plus, nous constatons que les trois individus avaient des ancêtres néandertaliens il y a quelques générations dans leur histoire familiale, confirmant que les premiers humains modernes européens se sont mélangés avec des néandertaliens et suggérant qu'un tel mélange aurait pu être commun."
Deuxième molaire inférieure d'un humain moderne trouvée dans la grotte Bacho Kiro dans le secteur principal associée aux outils en pierre du Paléolithique supérieur initial. Les données à l'échelle du génome de cet individu indiquent qu'il avait un ancêtre néandertalien moins de six générations avant de vivre. Un autre fragment humain du même individu a été trouvé dans la couche I dans la zone de la niche 1 de la grotte. Crédits: MPI-EVA / Rosen Spasov
Extrait : "En conclusion, les génomes de la grotte Bacho Kiro montrent que plusieurs populations humaines modernes distinctes existaient au début du Paléolithique supérieur en Eurasie. Certaines de ces populations, représentées par les individus Oase1 et Ust'Ishim, ne montrent aucune affinité détectable avec les populations ultérieures, tandis que les groupes liés aux individus de la grotte IUP Bacho Kiro ont contribué aux populations ultérieures d'ascendance asiatique ainsi que certains humains eurasiens occidentaux tels que le GoyetQ116-1 individuel en Belgique. Ceci est cohérent avec le fait que les assemblages archéologiques IUP se trouvent d'Europe centrale et orientale de l'actuelle Mongolie (Fig. 1), et une dispersion putative d'IUP qui s'est étendue de l'Europe de l'Est à l'Asie de l'Est " (YH : puis en Polynésie et Amériques comme l'indiquent les cartes de la publication).
Résumé 2 : " Les humains modernes se sont étendus en Eurasie il y a plus de 40000 ans après leur dispersion hors d'Afrique. Ces Eurasiens portaient environ 2 à 3% d'ascendance néandertalienne dans leurs génomes, provenant d'un mélange avec des Néandertaliens qui a eu lieu il y a entre 50 000 et 60 000 ans, probablement au Moyen-Orient. La constitution génétique des premiers Européens qui ont colonisé le continent il y a plus de 40 000 ans reste mal connue car peu de spécimens ont été étudiés. Ici, nous analysons un génome généré à partir du crâne d'un individu de sexe féminin qui a été nommé Zlatý kůň, en Tchéquie. Nous avons découvert qu'elle appartenait à une population qui semble avoir contribué génétiquement ni aux Européens plus tardifs ni aux Asiatiques. Son génome porte ~ 3% d'ascendance néandertalienne, semblable à celles des autres chasseurs-cueilleurs du Paléolithique supérieur. Cependant, les longueurs des segments de Néandertal sont plus longues que celles observées dans le génome humain moderne le plus ancien actuellement de l'individu Ust'-Ishim âgé d'environ 45000 ans de Sibérie, ce qui suggère que cet individu de Zlatý kůň est l'un des premiers habitants eurasiens. "
a , Emplacements de la grotte de Koněprusy, où les restes humains de Zlatý kůň ont été trouvés, et d'autres fossiles avec un âge d'au moins ~ 40 000 ans qui ont fourni des données à l'échelle du génome (Ust'-Ishim, Oase 1 et Tianyuan) ou ADNmt ( Fumane 2 et Bacho Kiro). b , Reconstruction virtuelle par tomographie micro-calculée du crâne de Zlatý kůň en vue frontale et latérale. La carte dans a a été créée avec QGIS 47 en utilisant les données vectorielles Natural Earth
Extraits de la publication : " Seuls trois génomes ont été récupérés sur des individus proches de la colonisation de l'Europe et de l'Asie il y a plus de 40 000 ans (ka). Un génome complet a été produit à partir des restes vieux d'environ 45 000 ans d'Ust'-Ishim, un individu sibérien qui n'a montré aucune continuité génétique avec les Eurasiens ultérieurs. Cela contraste avec l'individu d'Asie de l'Est de Tianyuan, âgé d'environ 40 000 ans, dont le génome est plus étroitement lié à de nombreux Asiatiques et Amérindiens d'aujourd'hui plutôt qu'aux Européens. En Europe, seul le génome partiel d'un individu appelé Oase 1 et daté d'environ 40 000 ans a été récupéré, et cela n'a montré aucune preuve d'ascendance partagée avec les Européens plus tardifs. Cependant, Oase 1 portait plus d'ascendance néandertalienne (6–9%) que les autres génomes humains modernes séquencés à ce jour, en raison du mélange avec des néandertaliens qui s'est produit au cours des six générations précédant la vie de l'individu."
" Nous avons extrait l'ADN de ~ 15 mg de poudre d'os de la partie pétreuse de Zlatý kůň de l'os temporal et d'abord enrichi et séquencé le génome mitochondrial (ADNmt) jusqu'à une couverture d'environ 150 fois (méthodes). On a estimé qu'environ 4% des séquences d'ADNmt provenaient d'une contamination humaine (section supplémentaire). Le reconstruit ADNmt appartient à l'haplogroupe N et sa longueur de branche, mesurée par le nombre de substitutions accumulées, est similaire à celles des génomes mitochondriaux humains modernes séquencés actuellement les plus anciennes (fig. 2a et. Étendue des données figure 3 ), y compris les ADNmt récemment publiés de Bacho Kiro, une grotte en Bulgarie avec des vestiges datant de 43 à 47 ka. La datation de la pointe bayésienne suggère que Zlatý kůň a vécu ~ 43 000 ans (95% de densité postérieure la plus élevée = 31,5–52,6 ka)."
Fig. 2: Relation génétique avec les humains actuels et anciens.
a , haplogroupe N d'ADNmt d'un arbre phylogénétique à parcimonie maximale d'ADNmt de Zlatý kůň (police rouge), individus du Paléolithique supérieur ~ 40 ka ou plus (bleu) ou entre ~ 37 et ~ 24 ka (orange), et individus actuels (noir) (l'arbre entier est présenté dans Extended Data Fig. 3 ). b , Analyse des séquences nucléaires montrant qu'Ust'-Ishim partage plus d'allèles avec les chasseurs-cueilleurs européens et asiatiques et plus tard avec les Eurasiens que Zlatý kůň. Les barres d'erreur représentent deux erreurs standard. c , Graphique d'adjonction de la relation déduite de l'ensemble de données de capture nucléaire. Zlatý kůň diverge plus tôt que Ust'-Ishim et les ancêtres des populations eurasiennes ultérieures représentées ici par les génomes du Paléolithique supérieur Tianyuan et Sunghir (valeur aberrante la plus élevée |Z | = 3). Un seul événement de flux génétique des Néandertaliens à l'ancêtre de tous les humains modernes testés correspond aux données. Les couleurs des individus suivent le même schéma que dans le panneau a.
Sources : Les humains du Paléolithique supérieur initial en Europe avaient une ascendance néandertalienne récente, Nature (2021). DOI: 10.1038 / s41586-021-03335-3
Une séquence génomique d'un crâne humain moderne de plus de 45 000 ans de Zlatý kůň en Tchéquie, Nature (2021). DOI: 10.1038 / s41559-021-01443-x
Articles liés :
https://www.sciencesetavenir.fr/archeo-paleo/des-traces-de-sapiens-datant-de-400-000-ans_21318
Dossier néandertal 1 : https://www.sciences-faits-histoires.com/pages/pages/dossier-neanderthal.html
Yves Herbo et Traductions, Sciences-Faits-Histoires, 16-04-2021, 08-2021
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